如果需要进行无线频率干扰仪屏蔽的区域是处于闹市区或者人口密集区，周边普通民众聚集较多的话，频率干扰仪系统是不建议长期连续开机工作的。这是因为无线频率干扰仪系统中几个必备的信号干扰频段，与普通民众生活所需要的通讯频段完全重叠，比如：GPS的民用导航定位频段、无线网络的WIFI2.4G频段和5.8G频段。一旦频率干扰仪开机工作后，针对这三个基础频段必然会进行有效干扰的。这样导致的结果就是：在受干扰的区域内，黑飞的无人机当然会被干扰到，但同时在此区域内的普通百姓，诸如手机导航、汽车导航等也有可能表现为失效状态，同时也会发现办公室内或者住宅内的WIFI无线网络、蓝牙设备等会有通讯不畅的现象。

无线频率干扰仪也可用于反制非法入侵的无人机，通常都具备针对各种无人机的驱离或者迫降功能。依据发射功率和配置的天线类型，其作用范围通常都会达到方圆500米甚至数公里。那么无线频率干扰仪作用如此明显，如果将它长期开机的话，对于普通民众生活会在使用某些特定频段工作的设备产生一定的影响。